Yupana

Yupana es una heramienta interactiva que permite el análisis y gráfica de datos basados en diseños experimentales.

Yupana permite:

Base de datos

Los datos deben estar organizado en formato tidy-data.

Tener en cuenta algunas consideraciones:

Las columnas que esten entre corchetes “[]” serán excluidas del análisis

Módulos

Módulos de la aplicación Yupana
Modules Description
Intro Página principal con la presentación de la aplicación. Interface para insertar el url del la hoja que se va analizar. Opciones para configurar el nombre del libro de campo (Fieldbook data) y la información resumen (Fieldbook summary).
Fieldbook Incluye dos sub módulos (1) Summary, para insertar los parámetros de acuerdo al diseño experimental de la base de datos. (2) Reshape, para reformar base de datos que se realizaron con la aplicación Tarpuy
Analysis Incluye tres sub módulos (1) Modelo, análisis y diagnósticos de las variables de acuerdo al modelo seleccionado en el módulo Fieldbook, puede cambiarse las opciones de forma directa en la hoja fbsm. (2) Diagnostic, modulo para observar los supuestos estadísticos y la distribución de los datos. (3) Gsheet, para visualizar la hoja fbsm para modificar los parámetros
Graphics Incluye dos sub módulos (1) Plots, gráfico de las variables exportadas en la hoja de cálculo. (2) Gsheet, para visualizar la hoja con la tabla del gráfico y modificar los parámetros
Multivariate Incluye tres sub módulos (1) PCA, selección de la variables para resumen de los datos y análisis de componentes principales. (2) HCPC, Análisis de cluster de los individuos. (3) CORR, correlación de las variables numéricas de la base de datos

Graphics

A continuación se presentará los parámetros y opciones que pueden ser modificadas dentro de la aplicación para la generación de gráficos.

Opciones de gráfico

Lista de argumentos, descripción y opciones para la generación de gráficos en la aplicación Yupana
arguments description options
type Tipo de gráfico bar - line
x Factor en el eje X columna tabla
y Variable numérica columna tabla
groups Factor de agrupación columna tabla
xlab Título eje X texto manual
ylab Título eje Y texto manual
glab Título de los grupos texto manual
ylimits Limites del eje Y (inicio*final*quiebres) texto manual
xrotation Rotación de etiquetas del eje X (angulo*horizontal*vertical) texto manual
sig Factor o variables para el texto de significancia columna tabla
error Barra de error: error estándar o desviación estandar ste - std
xtext Etiquetas del eje X (separado por comas “,”) texto manual
gtext Etiquetas de la leyenda (separado por comas “,”) texto manual
legend Posición de la leyenda top - left - right - bottom - none
dimensions Dimensión de la imagen en centímetros (largo*alto*dpi) texto manual
opt Agregar capas adicionales. e.g. coord_flip(), theme_minimal() texto manual

Nota: Opciones basadas en la función: plot_smr()

Argumentos y valores

Parámetros en `{arguments}` y `{values}` para la generación de gráficos en la aplicación Yupana.

Parámetros en {arguments} y {values} para la generación de gráficos en la aplicación Yupana.

Figura basada en los `{arguments}` y `{values}` de la tabla anterior.

Figura basada en los {arguments} y {values} de la tabla anterior.

La apliación por defecto genera un gama de colores {colors} en una escala de grises. Los colores pueden ser modificados de forma manual por sus nombres en ingles o usando los valores HEX. En este caso se cambió la escala de grises por los colores verde (green) y rojo (red).

Incluir nuevas capas opt

Yupana a partir de la versión 0.2.0 permite la inclusión de capas adicionales a los gráficos. Puedes incluir dicha información en opt de los {arguments}.

Puedes incluir diversas capas descritas para el paquete ggplot2.

Gráfico con la inclusión de la capa `facet_grid()`

Gráfico con la inclusión de la capa facet_grid()

Inclusión de `facet_grid(tratamiento ~ .)` en `opt` de los `{arguments}` en Yupana.

Inclusión de facet_grid(tratamiento ~ .) en opt de los {arguments} en Yupana.